Чесънът е нишковидна плитка коренова система без основен корен. Основната коренова група е разпределена в почвения слой в рамките на 5-25 cm, с хоризонтален диаметър 30 cm. По отношение на морфологията на растенията, самата луковица се развива от метаморфни клонове и нейните междувъзлия се съкращават в" луковични дискове" ;. Основата и ръбовете на стъблените дискове са вкоренени с корени, върху които листата и пъпките са примитивни. След диференциацията на цветните пъпки, апикалните пъпки образуват цветни дръжки, а страничните пъпки се разширяват, образувайки скилидки чесън. Методът на размножаване на чесъна е безполово размножаване, а размножителният орган е странична пъпка на тялото на майката' а именно скалната пъпка. Възрастното растение чесън се състои от корени, псевдостебла, листа, дръжки, луковици и др.
Листата на чесъна включват листно тяло и обвивка на листата. Листната обвивка е тръбна и расте на пръстен на стъблото. Многослойните обвивки на листа се прегръщат, за да образуват псевдостебло, което има функцията на механична поддръжка и доставка на хранителни вещества до луковицата.
